1937 rückte die japanische Armee von Shanghai aus weiter und griff Nanjing, die Hauptstadt der Republik China, an. Chiang Kai-Shek, Präsident der Republik, hatte seinen Elitetruppen die Evakuierung befohlen. Die Regierung zog auch den Jangtse hinauf. Die Armeeführer hielten es für besser, mit den besten Truppen im Landesinneren einen Zermürbungskrieg zu führen, als die Armee in Nanjing vernichten zu lassen. Zehntausende Soldaten blieben jedoch zurück, um die Stadt zu verteidigen. Ihnen wurde befohlen, die Stadt bis zum Tod zu verteidigen. Zivilisten versuchten zu fliehen, aber viele wurden in der Stadt gefangen, weil Brücken, Straßen und Transportmittel von Nanjing aus zerstört wurden, um den japanischen Vormarsch zu verlangsamen und die Truppen und Zivilisten in der Stadt zu halten.
Die Berichte über die Einnahme der Stadt durch Ausländer, die in der Stadt leben, und die Chinesen selbst zeugen von weit verbreiteten Vergewaltigungen und sinnlosen Tötungen von Zivilisten. Die Schätzungen über die Zahl der getöteten Chinesen in den sechs Wochen nach der Einnahme der Stadt durch die Japaner gehen stark auseinander. Die Schätzungen über die Zahl der Todesfälle gehen auseinander. Es war schwer zu sagen, weil viele Leichen in brennenden Häusern und Gebäuden verbrannt und viele in die Flüsse geworfen wurden. Es gab viele Plünderungen und kriminelle Handlungen sowohl gegen die Soldaten als auch gegen die Zivilisten. Vielleicht wäre es besser gewesen, wenn die Regierung den Zivilisten zur Flucht verholfen hätte und der Armee einen Fluchtweg eingeräumt hätte. Oder vielleicht hat der Kampf auf Leben und Tod, der sowohl in Shanghai als auch in Nanjing stattfand, dazu gedient, die Japaner zu beeindrucken, die auch dafür bekannt waren, im Zweiten Weltkrieg auf Leben und Tod zu kämpfen.
Das Mausoleum weist darauf hin, dass bei dem Massaker 300.000 Menschen getötet wurden. Andere Schätzungen schwanken zwischen weniger als 200.000 und mehr als 300.000 Toten. Der Grund für die unterschiedlichen Schätzungen liegt zum Teil darin, dass einige Schätzungen für die gesamte Stadtregion Nanjing und andere nur für das städtische Hauptzentrum gelten.
Das Denkmal wurde 1985 von der Stadtverwaltung von Nanjing errichtet und 1995 erweitert.